1. 2010年度“大熊猫保护遗传学研究”获得教育部自然科学二等奖;
2. 2008年度“濒危药用植物八角莲的保护遗传学及可持续利用”获得浙江省科学技术奖二等奖;
3. 2013年度“天目山植物多样性与珍稀濒危物种保育关键技术研究”获得浙江省科学技术奖二等奖;
4. 2016年度“中国及其邻近地区暖温带森林特有植物类群的谱系地理与物种形成”获得高等学校科学研究优秀成果奖自然科学奖二等奖;