生命系统稳态与保护教育部重点实验室的前身是“濒危野生动物保护遗传与繁殖教育部重点实验室”于2000年8月经教育部批准在浙江大学设立的。实验室曾于2010年1月改名为“濒危动植物保护生物学”，2018年9月再更名为现用名。

本实验室围绕“生命系统稳态与保护”主题，从分子→细胞→组织器官，从单一物种→群落生态等多层次、多维度开展生命科学的前沿基础和应用关键技术研究，培养高层次人才，实现生命科学学科的跨越式发展，提升我国在生命科学领域的研究水平。实验室的终极目标是建设世界一流科学研究基地，提出人与自然和谐的科学保护策略，从而服务生态文明建设、人民生命健康至上等国家重大战略需求。